Conversion d'un restaurant dans un bâtiment existant en un cinéma à deux salles de cinéma d'art et d'essai en 1969, le design était « avant-garde » avec une capacité réduite de 150 places par salle.
Situé dans une petite rue adjacente aux Champs-Élysées, le Lincoln fut si populaire qu'une salle de projection fut convertie en une troisième salle, ouverte le 5 octobre 1971 et conçue par l'architecte M. Bernard Ceyssac. Le cinéma a été rénové plusieurs fois, et le son Dolby a été installé dans les années 1980. Les places disponibles sont maintenant de 152 pour la Salle 1, 77 pour la Salle 2 et 145 pour la Salle 3.
Géré par la chaîne Multicine de cinéma d'art et d'essai, dirigée par Boris Gourevitch depuis le début, ce cinéma a été rénové récemment (septembre 2004) et a été rebaptisé Elysees-Lincoln en référence à la rue principale à proximité. Il diffuse des films dans leurs versions originales en langue d'origine.
